Наивысший расцвет хирургической анатомии связан с деятельностью Николая Ивановича Пирогова — великого анатома и хирурга, создателя топографической анатомии как самостоятельной науки, новатора методов "ледяной" анатомии и распилов замороженных трупов. Его основополагающие научные труды блистательно доказали важность практического значения анатомии для клинической медицины (см. ниже).

В конце XIX в. в ведущих научных центрах России сформировались крупные научные анатомические школы: в Московском университете — школа Д.Н.Зернова (1834-1917), который внес большой вклад в изучение анатомии центральной нервной системы; в Киевском университете — школа В.А.Беца (1834-1894) — создателя учения об архитектонике коры головного мозга.

В Петербурге функциональное направление в медицине развивал Петр Францевич Лесгафт (1838-1909) —основоположник теоретической анатомии и зачинатель отечественной науки о физическом воспитании. К оценке физического воспитания он пришел от анатомии: по Лесгафту, форма непрерывно изменяется под влиянием функций и условий питания, следовательно, совершенная форма здорового организма находится в прямой зависимости от активного воздействия на него упражнений, разработанных на научной основе. Таким образом, П.Ф. Лесгафт впервые проложил мост между анатомией и физическим воспитанием и образованием людей.

Внедрение новых методов исследования расширило возможности научной анатомии и еще более приблизило ее к клинической медицине. Так, открытие лучей Рентгена и создание рентгеноана-томии сделало возможным применение метода рентгенодиагностики в клинике. Значение анатомии для врача любой специализации трудно переоценить, ибо "врач не анатом не только бесполезен, но и вреден" (эпиграф к учебнику Е.О.Мухина "Курс анатомии") (Достижения и современная история анатомии изучаются на кафедре нормальной анатомии; см. учебник: Привес М.Г., Лысенков Н.K., Буш-кович В.И. Анатомия человека / Под ред. М.Г. Привеса. — 9-е изд., перераб. и дополн. — М.: Медицина, 1985. — С. 4-20.).