Граф Г.Г.Орлов постоянно консультировался с московскими врачами: Хр.Граве, Г.М.Орреусом, Д.С.Самойловичем, А.Ф.Шафонским, К.О.Ягел-ским и другими. По мнению врачей, следовало: увеличить число карантинов; при сортировке не направлять в карантины уже заболевших; организовать при карантинах специальные места для сохранения вещей; учредить несколько новых больниц за чертой города; создать специальные покои для самых тяжелых больных и для выздоравливающих; регламентировать время работы врачей и т.п. В последующем все это было реализовано.

Собранные таким образом сведения послужили основанием для издания императорского указа от 11 октября 1771 г. "Об учреждении двух Комиссий для прекращения моровой язвы".

В первую "Комиссию для предохранения и врачевания от моровой заразительной язвы" вошли врачи: доктора А.Ф.Шафонский, К.О.Ягелский и Г.М.Орреус, штаб-лекарь Хр. Граве и лекарь Д.С.Самойлович; возглавил ее генерал П.Д.Еропкин и его помощники: протоиерей Успенского собора А.Г.Левшин и статский советник В.Г.Баскаков, а также купец и мещанин Лука Долгой. В полное распоряжение комиссии были переданы все больницы, карантинные дома и аптеки Москвы, все медицинские чины и служители.

Комиссия определяла число больниц и карантинов и руководила их работой, вела ежедневную статистику заболеваемости и смертности и ежедневно сообщала об этом в Сенат, руководила очисткой города и сожжением всего подозрительного на заражение, активно занималась санитарным просвещением среди населения. Так, например, были изданы печатные листы "Как самому себя от язвы пользовать", "Краткое уведомление, каким образом познавать моровую язву, так же врачевать и предохраняться от оной" (М.Г.Орреус), "Каким образом яд язвенный в домах и вещах зараженных истреблять" (К.О.Ягелский). Есть все основания полагать, что в те дни эти виды санитарного просвещения были впервые применены в нашей стране. Комиссия обратилась ко всем московским врачам с призывом включиться в работу по борьбе с эпидемией, и к их чести — ни один не уклонился от выполнения своего врачебного долга.

Вторая комиссия — исполнительная — состояла из 3 человек под председательством тайного советника и сенатора Д.В.Волкова и занималась контролем за неуклонным практическим воплощением всех распоряжениий и указаний первой комиссии, а также за порядком, тишиной и безопасностью в городе.

Ввиду того, что в Москве все еще существовал панический страх перед направлением в больницы и карантины, граф Г.Г.Орлов применил тактику материального поощрения: все, добровольно поступавшие в больницы или карантины, получали при выписке новую одежду и денежное пособие — 5 р. холостым и 10 р. женатым (по тем временам это были большие деньги; для сравнения: корова тогда стоила 2-4 р., лошадь — 7-10 р., хорошие красные сапоги — 1 р. 40 к., пистолет — 2 р., позолоченая сабля — 20 р., рубаха и штаны — 40 к., пуд соли — 4 к.). "Таковое награждение, а к тому частые и скорые выпуски (из карантинов) столько действовали, что многие сами охотно приходили объявлять свою болезнь и просили, чтобы их отправить в каран-тин"*. Лицам, сообщавшим о сокрытии чумного больного, выдавалось вознаграждение в размере 10 р., а за разоблачение лиц, занимавшихся хищением или продажей чумного белья, — 20 р. Всего "на прекращение моровой язвы в одной только Москве было употреблено коронной казны более 400 тысяч рублей".