В течение десяти лет (1926-1936) он возглавлял детскую комиссию Всероссийского Центрального исполнительного комитета (ВЦИК).

После Великой Отечественной войны (1941-1945) по инициативе Н.А.Семашко началось изучение санитарных последствий войны. Он участвовал в создании Академии медицинских наук СССР (1944), стал одним из первых ее академиков и вошел в состав первого Президиума АМН СССР (ныне РАМН). В 1945-1949 гг. он был директором Института школьной гигиены Академии педагогических наук, а с 1945 г. — академиком Академии педагогических наук РСФСР. Под его руководством создавался Институт организации здравоохранения и истории медицины АМН СССР (ныне — Всесоюзный научно—исследовательский институт социальной гигиены,экономики и управления здравоохранением им. Н.А.Семашко РАМН), директором которого он был в 1947-1949 гг. Он был и первым председателем Высшего совета по делам физической культуры и спорта и возглавлял Правление Всесоюзного гигиенического общества (1940-1949). Научное наследие Н.А.Семашко — более 250 работ по организационным и теоретическим вопросам здравоохранения. Среди них "Очерки по теории организации советского здравоохранения" (1947).

Первым заместителем народного комиссара здравоохранения РСФСР был назначен Зиновий Петрович Соловьев (1876-1928). Наряду с этим с 1918 г. он был заведующим медицинской частью и членом коллегии Народного комиссариата внутренних дел, а также членом Совета врачебных коллегий.

В 1919 г. З.П.Соловьев был избран председателем Исполкома Российского общества Красного Креста, а в январе 1920 г. возглавил Главное военно-санитарное управление Рабоче-крестьянской красной армии (которое с августа 1918 г. входило в Народный комиссариат здравоохранения РСФСР).

В 1923 г. З.П.Соловьев организовал и возглавил вторую в стране кафедру со-циальнойлгигиены на медицинском факультете 2-го Московского государственного университета (позднее — 2-й Московский медицинский институт им. Н.И.Пирогова, ныне — Российский государственный медицинский университет) . По его инициативе в 1925 г. на берегу Черного моря был создан Всесоюзный пионерский лагерь "Артек".

В его трудах "Пути и перепутья современной медицины", "Профилактические задачи лечебной помощи", "Каких врачей должна готовить высшая медицинская школа", "Научные основы военно-санитарной службы" разрабатывались вопросы организации медицинского дела и медицинского образования в стране.

В июле 1936 г. постановлением ЦИК и Совета народных комиссаров СССР был создан Народный комиссариат здравоохранения СССР.